陆地植物DNA条形码研究获突破
植物研究所发表于2015年03月14日20:34:54 | 新闻资讯 | 标签(tags):陆地植物DNA条形码 ycf1 matK rbcL
扣押在海关的进口木材真的是报税单所列的物种吗?
标本馆中20-40%不能鉴定的标本怎么办?
大样地中没花没果物种如何鉴定?
从网上买的巴西松子是否真产于巴西,是哪个物种的种子?
放入煎药砂锅的中草药真如处方上所写?
餐馆服务员端上来的菜确实如菜谱里所写吗?
……
随着DNA条形码技术的应用,这些以前难以回答的问题都迎刃而解了。DNA条形码技术利用一些DNA序列的物种唯一性,达到准确鉴别物种的目的。DNA条形码技术依赖于参考序列库的正确性与完整性,而不依赖于材料的类型与完整性,且不要求使用者具有分类学知识,在未来生物材料的鉴定中必将发挥越来越重要的作用。
由于植物的特殊性,其DNA条形码一直难以确定。虽然matK和rbcL被建议作为陆地植物的DNA条形码,但由于其分辨率低,难以有效区分相近物种。系统与进化植物学国家重点实验室物种信息与快速鉴定研究组在所“一三五”重大项目的支持下,致力于从叶绿体基因组的层面评估和开发适合植物物种鉴定的DNA条形码。经过多年的努力,证明ycf1的两个区域是植物叶绿体基因组中变异最大的区域,其物种区分能力优于matK和rbcL的联合,适宜作为陆地植物的DNA条形码。
近日,这项研究成果在线发表于Scientific Reports期刊(DOI: 10.1038/srep08348)。文章还提供了扩增ycf1这两个区域的通用引物。
ycf1与matK和rbcL物种鉴别能力的对比